马来西亚伊斯兰法院（Syariah Court）是马来西亚法律制度两个独立的系统之一。法院负责管辖穆斯林人，而且一般只能判决不超过三年以下的有期徒刑，或者罚款高达5000令吉。

马来西亚宪法第145条说马来西亚总检察长不拥有相关伊斯兰教法庭事项权力。

马来西亚伊斯兰法院拥有三个级别的法院：上诉法院，高院，下院。