日本原子能研究所（Japan Atomic Energy Research Institute，JAERI）负责日本核电事务的机构。它根据日本原子能基本法在1956年6月成立。2005年10月1日，它合并日本核燃料循环开发机构后成为日本原子能研究开发机构。

日本原子能研究所旨在发展先进能源，如原子能，核设施安全性，以及防护辐射技术。